我们的框架包含其他现有生物神经网络模型中缺少的特征，包括可以跟踪系统中单个细胞的发展，记录大量与生物学相关的参数的变化，并描述整个细胞种群行为。生物细胞神经网络建模（BCNNM）方法使用生化反应序列的谓词描述，它可用于从有限数量的干细胞运行多层神经网络形成的复杂模型。模型运行回顾了神经系统发育中的关键细胞事件。 BCNNM 框架基于动态建模原则实现，具有概率过程描述的可能性。

生物机制可以全面描述，用户可以选择所需的细节来描述过程（从细胞内酶浓度的变化到细胞组的相互作用形成高级多细胞结构）。 我们可以构建具有稀疏和特定连接的结构，在此类结构中创建信号传导模型，并揭示其工作的特殊性。

该框架可用于彻底进行体外实验的硅复制，旨在从所有关键组件（细胞、其隔间、突触等）获得详尽的测量结果，为神经研究提供新的数据。 新假设的初步计算测试是另一个重要的应用，降低湿实验室实验设置成本、加快研究渠道。