Старение связано с такими процессами, как снижение физиологических функций, повышение уязвимости к заболеваниям, хроническое воспаление и другими. Однако влияние здорового старения на молекулярное программирование клеток изучено недостаточно.

В рамках совместного исследовательского проекта с лабораторией Максима Артемова в Вашингтонском университете в Сент-Луисе мы стремимся понять старение человека на всех уровнях — от молекулярного до организменного — путем всестороннего и системного анализа широкомасштабных мультиомических наборов данных. Эти наборы данных включают в себя транскриптомику, эпигеномику, метаболомику, протеомику, клинические анализы крови и др. Конечная цель — выявить основные факторы старения человека на основе хорошо контролируемых продольных данных.

Исследовательская группа разрабатывает новые методы и создает вычислительные пайплайны для каждого этапа анализа экспериментальных данных. Наш опыт в области биоинформатики, машинного обучения и разработки программного обеспечения позволяет нам сочетать лучшие практики, необходимые для создания надежных и масштабируемых пайплайнов.

Основные публикации:

1. Shchukina, I., Bagaitkar, J., Shpynov, O. et al. Enhanced epigenetic
   profiling of classical human monocytes reveals a specific signature of
   healthy aging in the DNA methylome. Nat Aging 1, 124–141 (2021).
2. Mogilenko, D., Shpynov, O. et al. Comprehensive profiling of an aging immune
   system reveals clonal GZMK+ CD8+ T cells as conserved hallmark of
   inflammaging. Immunity 54.1 (2021): 99-115.
3. Arthur, L., Esaulova, E., Mogilenko, D. et al. Cellular and plasma
   proteomic determinants of COVID-19 and non-COVID-19 pulmonary
   diseases relative to healthy aging. Nat Aging 1, 535–549 (2021).