연구
BioLabs
BioLabs 그룹의 목표는 인간과 동물의 후성 유전학적 조절의 기본 메커니즘을 밝히고 세포분화 및 노화에서 이러한 메커니즘의 역할을 확인하는 것입니다. 저희 연구소는 실험 데이터 분석을 위한 새로운 알고리즘과 방법을 개발하고, 확장 가능한 계산 파이프라인과 도구를 빌드하고, 다양한 노화 연구에서 생물학자들과 협력하고 있습니다.
연구 프로젝트
Longitudinal analysis of human aging
노화는 생리 기능 감소, 질병에 대한 취약성 증가, 만성 염증 등과 같은 과정과 관련이 있습니다.그러나 건강한 노화가 세포의 분자 프로그래밍에 미치는 영향은 잘 알려져 있지 않습니다.
세인트루이스에 있는 워싱턴 대학의 Maxim Artyomov 실험실과 공동으로 실시하는 연구 프로젝트에서 우리는 대규모 다중 오믹스 데이터 세트를 포괄적으로 특성화하고 이에 관한 시스템 분석을 수행함으로써 분자 수준부터 장기 및 유기체 수준에 이르는 모든 수준에서 인간 노화를 이해하는 데 목표를 두고 있습니다.이러한 데이터 세트에는 벌크 및 단일 세포 전사체학, 후성유전체학, 대사체학, 단백질체학, 임상 혈액 검사 등이 포함됩니다.궁극적인 목표는 잘 제어된 종적 데이터를 사용하여 인간의 주요 노화 요인을 찾아내는 것입니다.
이 그룹은 새로운 방법을 개발하고 실험 데이터 분석의 모든 단계에 이용할 계산 파이프라인을 구축하는 일을 하고 있습니다.생물 정보학, 머신러닝 및 소프트웨어 개발에서 다진 당사의 전문 지식을 통해 강력하고 확장 가능한 파이프라인을 구축하는 데 필요한 최선의 방식을 결합할 수 있습니다.
주요 간행물:
- Shchukina, I., Bagaitkar, J., Shpynov, O. 외. 고전적인 인간
단핵구의 향상된 후생유전학적 프로파일링을 통해
DNA 메틸롬에서 건강한 노화의 특정 서명을 밝힙니다.Nat Aging 1, 124–141 (2021). - Mogilenko, D., Shpynov, O. 외. 노화 면역 시스템의 포괄적인
프로파일링을 통해 염증의 보존된 특징으로서 클론
GZMK+ CD8+ T 세포를 밝힙니다.Immunity 54.1 (2021): 99-115. - Arthur, L., Esaulova, E., Mogilenko, D. 외. 건강한 노화와
관련된 COVID-19 및 비 COVID-19 폐 질환의 세포 및
혈장 단백 결정 인자.Nat Aging 1, 535–549 (2021).