Les objectifs du groupe BioLabs sont de découvrir les mécanismes qui gouvernent la régulation épigénétique chez les humains et les animaux, et d'identifier le rôle de ces mécanismes dans la différenciation et le vieillissement des cellules. Nous développons de nouveaux algorithmes et de nouvelles méthodes pour l'analyse des données expérimentales, élaborons des pipelines et des outils informatiques évolutifs, et travaillons en collaboration avec des biologistes dans le cadre de diverses études sur le vieillissement.
Longitudinal analysis of human aging
Le vieillissement est associé à un ralentissement des fonctions physiologiques, une plus grande vulnérabilité aux maladies, des inflammations chroniques et bien plus encore. Cependant, l'impact d'un vieillissement sain sur la programmation moléculaire des cellules est mal comprise.
Un projet commun en collaboration avec le laboratoire Maxim Artyomovde la Washington University à St.Louis, nous permettra de comprendre le vieillissement humain à tous les niveaux, du niveau moléculaire au niveau organique en passant par les fonctions propres aux organes, en opérant une caractérisation complète et une analyse des systèmes à partir de jeux de données multi-omniques à grande échelle. Ces jeux de données inclut des transcriptomiques mono-cellulaires et en masse, l'épigénomique, la métabolomique, la protéomique, les tests sanguins cliniques et autres. L'objectif ultime est d'identifier les facteurs majeurs de vieillissement humain au moyen de données longitudinales bien contrôlées.
Ce groupe crée de nouvelles méthodes et met en place des pipelines de calcul pour tous les stades d'analyse des données expérimentales. Notre expertise en bio-informatique, machine learning et développement logiciel nous permet d'appliquer les meilleures pratiques indispensables pour créer des pipelines robustes et évolutifs.
Principales publications :